正しくはHTML化の時にルビをふるようにする方法。EmacsWiki上での視覚処理の方法がわからないのですが、現時点ではそちらは放置してあります。いい方法があったら教えてください。
[文字<もじ>] →
表記がちと汚いです……が、必要ならそこだけ別途機械変換しましようってことで。
(setq emacs-wiki-publishing-markup (list ;; ルビタグ ["\\[\\(\\S-+\\)<\\(\\S-+\\)>\\]" 0 "<ruby>\\1<rp>(</rp><rt>\\2</rt><rp>)</rp></ruby>"] emacs-wiki-publishing-markup))